MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 80963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008700	TTG	2	6	88	93	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773143
2	NC_008700	TTC	2	6	112	117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773143
3	NC_008700	AAT	2	6	185	190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773143
4	NC_008700	CAA	2	6	192	197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773143
5	NC_008700	GTG	2	6	479	484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773143
6	NC_008700	CAA	2	6	662	667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773144
7	NC_008700	GTC	2	6	678	683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773144
8	NC_008700	GCC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773144
9	NC_008700	TGA	2	6	724	729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773144
10	NC_008700	GGT	2	6	761	766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773144
11	NC_008700	TGA	2	6	854	859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773144
12	NC_008700	CTG	2	6	876	881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773144
13	NC_008700	GTTACT	2	12	953	964	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119773144
14	NC_008700	AGG	2	6	967	972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119773144
15	NC_008700	CAG	2	6	994	999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773144
16	NC_008700	ATC	2	6	1009	1014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773144
17	NC_008700	ATG	2	6	1029	1034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773144
18	NC_008700	ACC	2	6	1088	1093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773144
19	NC_008700	GCG	2	6	1146	1151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773144
20	NC_008700	TGG	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773144
21	NC_008700	TGA	2	6	1394	1399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773144
22	NC_008700	CAA	2	6	1477	1482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773144
23	NC_008700	TGA	3	9	1541	1549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773144
24	NC_008700	AGT	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773145
25	NC_008700	CCA	2	6	1710	1715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773145
26	NC_008700	CAAT	2	8	1743	1750	50 %	25 %	0 %	25 %	119773145
27	NC_008700	GCC	2	6	1912	1917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773145
28	NC_008700	TGC	2	6	1935	1940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773145
29	NC_008700	TGC	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773145
30	NC_008700	CAC	2	6	1990	1995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773145
31	NC_008700	GCCC	2	8	2053	2060	0 %	0 %	25 %	75 %	119773145
32	NC_008700	TCG	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773145
33	NC_008700	CGC	2	6	2106	2111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773145
34	NC_008700	CAA	2	6	2130	2135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773145
35	NC_008700	GCCT	2	8	2170	2177	0 %	25 %	25 %	50 %	119773145
36	NC_008700	GGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773145
37	NC_008700	GCT	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773145
38	NC_008700	TGA	2	6	2303	2308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773145
39	NC_008700	GCCA	2	8	2322	2329	25 %	0 %	25 %	50 %	119773145
40	NC_008700	GGC	2	6	2368	2373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008700	CAA	2	6	2514	2519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773146
42	NC_008700	CGC	2	6	2547	2552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773146
43	NC_008700	CCGG	2	8	2575	2582	0 %	0 %	50 %	50 %	119773146
44	NC_008700	ACCGGC	2	12	2617	2628	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119773146
45	NC_008700	GAT	2	6	2635	2640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773146
46	NC_008700	GCA	2	6	2665	2670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773146
47	NC_008700	GC	3	6	2676	2681	0 %	0 %	50 %	50 %	119773146
48	NC_008700	TCACAT	2	12	2688	2699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773146
49	NC_008700	CGC	2	6	2727	2732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773146
50	NC_008700	CAA	2	6	2745	2750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773146
51	NC_008700	T	6	6	2809	2814	0 %	100 %	0 %	0 %	119773146
52	NC_008700	ATG	2	6	2852	2857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773146
53	NC_008700	TGG	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773146
54	NC_008700	CCG	2	6	2889	2894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773146
55	NC_008700	CAG	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773146
56	NC_008700	AC	3	6	3001	3006	50 %	0 %	0 %	50 %	119773146
57	NC_008700	TCC	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119773146
58	NC_008700	GCA	2	6	3054	3059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773146
59	NC_008700	AGC	2	6	3081	3086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773146
60	NC_008700	GTG	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773146
61	NC_008700	GC	3	6	3164	3169	0 %	0 %	50 %	50 %	119773146
62	NC_008700	CTG	2	6	3171	3176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773146
63	NC_008700	CGG	2	6	3225	3230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773146
64	NC_008700	CCA	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773146
65	NC_008700	GCC	3	9	3298	3306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773146
66	NC_008700	TCG	2	6	3344	3349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773146
67	NC_008700	AC	3	6	3376	3381	50 %	0 %	0 %	50 %	119773146
68	NC_008700	GCCT	2	8	3412	3419	0 %	25 %	25 %	50 %	119773146
69	NC_008700	GCA	2	6	3423	3428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773146
70	NC_008700	CTT	2	6	3438	3443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773146
71	NC_008700	GGC	2	6	3478	3483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773146
72	NC_008700	TAA	2	6	3492	3497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773146
73	NC_008700	TTCC	2	8	3516	3523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008700	TG	4	8	3602	3609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008700	TATT	2	8	3620	3627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008700	AAT	2	6	3679	3684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008700	TTG	2	6	3711	3716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773147
78	NC_008700	GCA	2	6	3816	3821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773147
79	NC_008700	GCC	2	6	3888	3893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773147
80	NC_008700	GTC	2	6	3931	3936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773147
81	NC_008700	GCA	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773147
82	NC_008700	TGC	2	6	4122	4127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773147
83	NC_008700	TTC	2	6	4132	4137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773147
84	NC_008700	ATG	2	6	4139	4144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773147
85	NC_008700	TGG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773147
86	NC_008700	GCC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773147
87	NC_008700	GC	3	6	4209	4214	0 %	0 %	50 %	50 %	119773147
88	NC_008700	GTC	2	6	4236	4241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773147
89	NC_008700	TGAAGG	2	12	4305	4316	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	119773147
90	NC_008700	GCA	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773147
91	NC_008700	GCTG	2	8	4348	4355	0 %	25 %	50 %	25 %	119773147
92	NC_008700	TAT	2	6	4394	4399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119773147
93	NC_008700	TGC	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773147
94	NC_008700	AAG	2	6	4461	4466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773147
95	NC_008700	TGA	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773147
96	NC_008700	GGT	2	6	4564	4569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008700	TTG	2	6	4593	4598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008700	GAA	2	6	4688	4693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773148
99	NC_008700	AAT	2	6	4710	4715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773148
100	NC_008700	TTGGG	2	10	4718	4727	0 %	40 %	60 %	0 %	119773148
101	NC_008700	GTG	2	6	4803	4808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773148
102	NC_008700	GCT	2	6	4925	4930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773148
103	NC_008700	GAA	2	6	4940	4945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773148
104	NC_008700	GGCA	2	8	5069	5076	25 %	0 %	50 %	25 %	119773148
105	NC_008700	GGC	2	6	5211	5216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008700	ATA	2	6	5238	5243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008700	AATC	2	8	5247	5254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008700	GA	3	6	5286	5291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008700	GAA	2	6	5348	5353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773149
110	NC_008700	TGCT	2	8	5362	5369	0 %	50 %	25 %	25 %	119773149
111	NC_008700	ATA	2	6	5380	5385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773149
112	NC_008700	CGG	2	6	5413	5418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773149
113	NC_008700	CGG	2	6	5447	5452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773149
114	NC_008700	GCG	2	6	5469	5474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773149
115	NC_008700	GTT	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773149
116	NC_008700	TGA	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773149
117	NC_008700	GCA	2	6	5537	5542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773149
118	NC_008700	CAC	2	6	5607	5612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773149
119	NC_008700	GCGT	2	8	5617	5624	0 %	25 %	50 %	25 %	119773149
120	NC_008700	TGA	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773149
121	NC_008700	CAA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773149
122	NC_008700	ACCG	2	8	5856	5863	25 %	0 %	25 %	50 %	119773149
123	NC_008700	GGC	2	6	5868	5873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773149
124	NC_008700	GCA	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773149
125	NC_008700	TGG	2	6	5947	5952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773149
126	NC_008700	CGG	2	6	6034	6039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773149
127	NC_008700	GCT	2	6	6107	6112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773149
128	NC_008700	TGA	2	6	6151	6156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773149
129	NC_008700	GGATT	2	10	6251	6260	20 %	40 %	40 %	0 %	119773149
130	NC_008700	TTG	2	6	6312	6317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773149
131	NC_008700	TGG	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773149
132	NC_008700	AT	3	6	6409	6414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008700	TGTT	2	8	6422	6429	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008700	GGTG	2	8	6430	6437	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_008700	AAG	2	6	12384	12389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773156
267	NC_008700	AGC	2	6	12439	12444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773156
268	NC_008700	TGC	2	6	12460	12465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773156
269	NC_008700	GAA	2	6	12507	12512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773156
270	NC_008700	TAC	2	6	12624	12629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773156
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273	NC_008700	TGG	2	6	12874	12879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773156
274	NC_008700	TGC	2	6	12907	12912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773156
275	NC_008700	TGC	2	6	12967	12972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773156
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277	NC_008700	CTG	2	6	13017	13022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773156
278	NC_008700	CAA	2	6	13049	13054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773156
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280	NC_008700	ATC	2	6	13080	13085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773156
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282	NC_008700	GAA	2	6	13227	13232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773156
283	NC_008700	TTG	2	6	13288	13293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_008700	GCG	2	6	13550	13555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773157
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289	NC_008700	GCT	2	6	13784	13789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773157
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299	NC_008700	AAGG	2	8	14377	14384	50 %	0 %	50 %	0 %	119773157
300	NC_008700	CGA	2	6	14456	14461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_008700	GA	4	8	14460	14467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_008700	GTT	2	6	18738	18743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773161
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